Япония — это островное государство, которое располагается на дугообразном архипелаге, состоящем из чуть менее 7 тысяч островов. Эти острова протянулись на общее расстояние более 3800 километров вдоль восточного побережья Евразии. То, что эта находится на востоке от материка, и дало ей название Страна восходящего солнца.
Основные острова архипелага — это Хоккайдо, Хонсю, Сикоку и Кюсю — их японцы даже не называют островами, а именуют основной землей, основной территорией: на них приходится 98% всей страны. Они соединены между собой при помощи мостов и подводных туннелей, что позволило превратить разрозненное территориальное пространство страны в единое сухопутное образование.
Горы — характерная особенность Японского архипелага, они покрывают 71% суши, и лишь отдельные участки вдоль побережий или русла больших рек — равнины и низменности, которые окаймляют горные системы.
Климат Японии, за исключением острова Хоккайдо, умеренный с четырьмя четко различимыми временами года и двумя периодами дождей, весной и осенью, которые предшествуют лету и зиме соответственно. Период дождей — так называемый «байу» (дословно — «сливовый дождь»), — начинается в мае на юге Окинавы и в середине июня в районе Тохоку на севере Хонсю и заканчивается в середине июня и июля соответственно.
Реки Японии относительно коротки: самая протяженная из них, Синано, имеет длину всего лишь 367 км. Однако уклон рек крут, много потоков свергаются вниз водопадами, пока не достигают моря. Это приводит к большим перепадам уровня воды: так, во время разливов река Тонэ может соперничать с Нилом.
Озера в Японии двух типов: мелководные лагунные озера на прибрежных низменностях и озера тектонического происхождения, образовавшиеся в результате разломов (озеро Бива) или на месте кратеров вулканов (озеро Товада).